1997 жылдан 1999 жылға дейін Alkaloid компаниясы өңірде және оның шегінен тыс жерде жетекші ретінде фармацевтикалық өнімдер мен химиялық заттарды өндіру бөлімшелері, сондай-ақ косметика мен өсімдік өнімдерін өндіру бөлімшелері үшін менеджмент жүйелерінің сапасын халықаралық ISO 9001 стандартына сәйкестендіріп сертификаттаған алғашқы компаниялардың бірі болды. 2000-2001 жылдары Alkaloid AD Skopje Македониядағы (2019 жылдан бастап Солтүстік Македония Республикасы) алғашқы компания болып, өсімдік және фармацевтикалық өнімдерді өндіру бөлімшелері үшін экологиялық менеджмент жүйелеріне халықаралық ISO 14001 стандартына сәйкес сертификаттар алды. Барлық ISO сертификаттарын Австрияның сапа сертификаттау органы (бұрынғы ÖQS) берді және IQNet халықаралық сертификаттау желісімен аккредиттелді.
2007-2010 жылдар аралығында химиялық заттар өндірісі шеңберінде медициналық мақсаттағы бұйымдар – гемодиализ үшін концентрленген ерітінділер мен рентген пленкасын өндіру DEKRA Certification B.V. (бұрын KEMA Quality B.V.) атты танымал сертификаттау органы тарапынан CE сертификаттарын алды. 2011 жылы Alkaloid AD Skopje компаниясының химиялық заттарды, косметикалық құралдарды және өсімдік өнімдерін өндіру бөлімшесінің химиялық заттар мен медициналық бұйымдарды өндіру бағдарламасы 13485 стандарт талаптарына сәйкестікті енгізу мен қамтамасыз ету мақсатында сапа менеджменті жүйесі бойынша сертификат алды.
Alkaloid AD компаниясының «Денсаулық бәрінен жоғары» қағидасына берілгендігін растайтын сертификат – 17.04.2007 жылы өсімдік өнімдері зауытына берілген HACCP сертификаты, ол бүкіл өндіріс бағдарламасына: шәй, қоспалар, дәмдеуіштер, кептірілген көкөністер, тұз және «Zachinal» дәмдеуіштеріне таралады. Сертификация Quality Austria сертификаттау органы тарапынан жүргізілді.
2002 жылы Alkaloid компаниясы қатты пероральді дәрілік формаларды өндіруге арналған жаңа зауытты іске қосты, ол еуропалық және халықаралық GMP талаптарына сәйкес салынды. Бұл талаптарға сәйкестікті растау Македонияның денсаулық сақтау министрлігі тарапынан дәрілік заттарды өндірушіге GMP сертификатын алғаш рет беру үшін негіз болды. Alkaloid компаниясы өзінің жаңа цефалоспориндерді өндіру зауыты үшін де GMP сертификатын алды, ол ұлттық ережелер, ЕС-тің 2001/83/ЕС және 2003/94/ЕС директивалары мен ДДҰ-ның нұсқаулықтарына сәйкес келеді.
1998 жылы іске қосылған өсімдік өнімдерін өндіру бағдарламасы Нидерландтың Control Union Certifications (бұрынғы SKAL) компаниясымен тексеруден өтті және органикалық өнім өндіру әдістері бойынша ЕС-тің 2092/91 директивасына сәйкес алғашқы сертификатқа ие болды, бұл Балқан елдеріндегі осындай сертификаттардың алғашқысы болды. Органикалық өнім өндіру әдістері бойынша сертификаттардың халықаралық маңыздылығы АҚШ-тың ауыл шаруашылығы министрлігінің ұлттық органикалық бағдарламасына сәйкес тексеру барысында үш континентте расталды, сондай-ақ Нидерландтың Control Union Certifications компаниясы арқылы жүргізілген жапон стандарттары бойынша органикалық өнімдер (JAS) үшін тексеру кезінде де дәлелденді.
Медициналық өнімдерді өндіру – гемодиализ үшін концентрлі ерітінділер мен рентген пленкаларын өндіру – 2007-2010 жылдар аралығында химиялық заттарды өндіру бағдарламасы аясында Нидерландтың DEKRA Certification B.V. (бұрын KEMA Quality B.V.) сертификациялық органынан CE сертификаттарын алды. 2011 жылы Alkaloid AD Skopje компаниясының химиялық заттарды, косметикалық құралдарды және өсімдік өнімдерін өндіру бөлімшесінің химиялық заттар мен медициналық өнімдерді өндіру бағдарламасы ISO 13485 стандарт талаптарына сәйкестікті қамтамасыз ету және енгізу бойынша сапа менеджменті жүйесі сертификатын алды.
Alkaloid AD компаниясының «Денсаулық бәрінен жоғары» қағидасына адалдығын растайтын сертификат – 2007 жылдың 17 сәуірінде расталған HACCP сертификаты, ол өсімдік өнімдерін өндіретін зауытқа берілген. Бұл сертификат бүкіл өндіріс бағдарламасына, яғни шайлар, қоспалар, дәмдеуіштер, кептірілген көкөністер, тұз және «Zachinal» дәмдеуіштеріне таралады. Сертификация Quality Austria сертификациялық органы арқылы жүргізілді.
2012 жылы Quality Austria Alkaloid компаниясының Интеграцияланған менеджмент жүйесіне (IMS) алғаш рет матрицалық аудит жүргізді және оның ISO 9001 және ISO 14001 халықаралық стандарттарына (барлық өндірістік алаңдар мен үрдістер 100%) сәйкестігін растады. Бұл сертификаттар ALKALOID AD, ALKALOID CONS DOOEL, ALKALOID d.o.o. BELGRADE және ALKALOID VELEDROGERIJA d.o.o. BELGRADE компанияларына, сонымен қатар фармацевтикалық өнімдерді жүзеге асыратын бөлімшеге 13485 стандартына сәйкестігін, сондай-ақ өсімдік бағдарламасы мен фармацевтикалық өнім үшін HACCP қағидаларі мен талаптарына толық сәйкестігін растады.
Қоршаған ортаға қамқорлық Alkaloid AD Skopje компаниясының ұзақ мерзімді бизнес саясатының бірі болып табылады, және экологиялық менеджмент жүйесі оның интеграцияланған менеджмент жүйесінің бөлігі болып табылады. 2012 жылы Қоршаған орта және аумақтық жоспарлау министрлігі Автокомандадағы PC Pharmacy кәсіпорнына қоршаған ортаны кешенді ластанудан қорғау және бақылау бойынша операциялық жоспарға сәйкестігі үшін «А» категориялы рұқсат берді, бұл Alkaloid компаниясын өз өндірістік қызметінде ластануды бақылау және алдын алу жөніндегі шараларды жүзеге асыратын корпоративтік жауапкершілігі бар компаниялар тобына енгізді.
2020 жылы Alkaloid AD Skopje компаниясы халықаралық ISO 45001 стандарттарына сәйкестік сертификатын алу арқылы өзінің жетекші позицияларын нығайтты.